解锁原神小岛秘境需要按照特定步骤操作，其中海祗岛秘境是较为典型的案例。首先需要前往秘境附近参拜基柱，获取雷种子后引导四个雷霆探针至正确方向，解封雷元素柱子。当角色附带雷元素或持有雷种子时，指针会跟随转动，需等待其与底盘指示方向一致出现紫色光圈后停止移动，使指针定格。完成此步骤后即可点亮雷元素柱子，水位会下降一半，可跳入水中继续后续解谜。
进入水位下降后的区域需要顺着洞口游进去，游到尽头后往右边墙体向上攀爬。此处需注意墙上有三个机关需要启动，按左→中→右的顺序激活后会触发石板升起机制并打开铁门。进入铁门后再次攀爬至可看见继电石的位置，开启机关会使水位完全下降。水位退去后秘境大门将完全显露，这是解锁秘境的最后关键步骤。整个过程需要合理运用雷元素角色技能，推荐携带皇女或九条裟罗等角色以应对解谜需求。
部分小岛秘境如鹤观岛的茂知之壳则需要采用不同方法解锁。该秘境位于鹤观岛上方远处小岛上，建议从鹤观岛开船前往。解锁条件为点亮三个被禁锢的雷元素方碑，需要通过传送门飞往旁边三个小岛完成限时挑战来解除禁锢。挑战内容包括收集雷微颗粒、击败武士和引爆炸药桶，完成每个挑战可获得宝箱奖励。三个方碑全部点亮后即可开启秘境并额外获得珍贵宝箱。
对于蒙德地区的无名小岛隐藏任务，解锁方式更为特殊。需要从摘星崖飞往小岛或使用凯亚铺冰过去，到达后打碎石堆获取残破的笔记。根据提示将时间调至凌晨2-5点，使用元素视野观察日晷痕迹，用风元素技能驱散四个风眼后会出现狂风之核。击败狂风之核后乘坐生成的风场前往下一个任务地点，在千风神殿再次驱散风眼即可完成任务解锁相关区域。整个过程对角色体力和元素技能运用有较高要求。
秘境解锁后的探索也需注意相关机制。部分秘境中存在多重机关联动，需要触发特定条件才能继续深入。例如海祗岛秘境深处存在守护者渊海兽，推荐组队应对其群体AOE技能。解密成功后可获得稀有材料如深海之核和五星武器图纸等奖励。建议在探索前做好充分准备，携带适合的角色和物资以确保顺利完成任务。
